導入阿米巴的目的是為了將組織進行細分，通過獨立核算能夠將企業的各個細枝末節看得更清楚，從而能夠采取及時有效的對策。
    對于各阿米巴的負責人而言，通過這種方式，他們被培養為與經營者在價值觀和思維方式上相近的人才。
    可見，導入阿米巴的目的第一是為了細化經營組織，實現精細化的管理，第二則是為了培養更多的經營者的“分身人才”。
然而，阿米巴經營的本質并不是“分權治理”，建立一個關于“如何分錢”的利益機制與阿米巴的負責人捆綁，然后“老板解放”。一旦這樣做了，企業就會面臨“分裂”的風險。

    阿米巴經營的本質是“合”，而不是“分”。必須指出的是，中小民營企業是市場競爭的弱者，本來資源就有限，卻反而還要劃分為更小的治理單位，各自為政，這不是誤入歧途嗎？很多人會用七十年代中國農村實行的“家庭聯產承包責任制”，即“包產到戶”來比喻阿米巴經營，但這絕對是天大的誤區，兩者之間存在天壤之別。
    兩者的主要區別在于：
    1.承包制：追求利潤，分錢、賺錢，注重短期，急功近利，承包方老大利益最大化，以利益為指標。
    承包經營是指將企業”經營所有權”全部或部分在一定期限內交給承包者，由承包者對企業進行經營管理，并承擔經營風險及獲取企業收益的行為。
    2.阿米巴經營：以培養人才為主，貫徹經營方針，注重長期利益，注重集體發展共生共贏，注重短期更注重長期全員共享。
    阿米巴經營就是通過組織劃分成一個個小集體，通過獨立核算和內部交易等工具，在企業內部不斷培養有經營意識的人才，實現全體員工共同參與經營。阿米巴經營模式是在稻盛和夫哲學的指引下的一種具體經營手法，其化小組織單元最主要的目的在于衡量和激勵人的績效，其核心是經營人。無論從經營的事務性來看，還是從人員的團隊化、社會化需求來看，組織單元不必要無限劃小，而應該有一個可以達到經營人的最佳規模。為了實現這種最佳規模，稻盛和夫也提出了組織劃分的基本原則。